Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms