Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN11Q9UMQ6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN11Q9UMQ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms