Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN16Q9UKR8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms