Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms