Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK23

NAGPA, N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGPAQ9UK23 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGPAQ9UK23 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGPAQ9UK23 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGPAQ9UK23 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGPAQ9UK23 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGPAQ9UK23 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGPAQ9UK23 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGPAQ9UK23 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGPAQ9UK23 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAGPAQ9UK23 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAGPAQ9UK23 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms