Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX4Q9UIU6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms