Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFMBT1Q9UHJ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFMBT1Q9UHJ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms