Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMGXB4Q9UGU5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms