Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCF2Q9UG63 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms