Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VTI1BQ9UEU0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VTI1BQ9UEU0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms