Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CFDP1Q9UEE9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CFDP1Q9UEE9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CFDP1Q9UEE9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CFDP1Q9UEE9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CFDP1Q9UEE9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CFDP1Q9UEE9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CFDP1Q9UEE9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CFDP1Q9UEE9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFDP1Q9UEE9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms