Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGC1AQ9UBK2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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