Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XCL2Q9UBD3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XCL2Q9UBD3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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