Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNMT3BQ9UBC3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNMT3BQ9UBC3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms