Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
MBD5Q9P267 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MBD5Q9P267 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MBD5Q9P267 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms