Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SH3BP4Q9P0V3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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