Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2L1Q9P0L9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms