Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCMF1Q9P0J7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms