Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP1Q9NZI2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP1Q9NZI2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP1Q9NZI2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP1Q9NZI2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP1Q9NZI2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms