Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDE1Q9NZC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
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