Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNK4Q9NYG8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNK4Q9NYG8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms