Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC10Q9NYD6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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