Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT1Q9NXH9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms