Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARCH5Q9NX47 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms