Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCLQ9NW38 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCLQ9NW38 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms