Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT13Q9NUP7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms