Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCC13Q9NSE7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCC13Q9NSE7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCC13Q9NSE7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCC13Q9NSE7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCC13Q9NSE7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCC13Q9NSE7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCC13Q9NSE7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCC13Q9NSE7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCC13Q9NSE7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCC13Q9NSE7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms