Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM7SF3Q9NS93 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM7SF3Q9NS93 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms