Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPRMQ9NS64 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPRMQ9NS64 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms