Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SERINC1Q9NRX5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms