Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA4L2Q9NRX3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms