Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6BQ9NRW1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms