Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.891e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-201ENST00000378543 569 ntTSL 236.26■■■■□ 3.391e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-206ENST00000414253 2216 ntTSL 235.53■■■■□ 3.281e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-203ENST00000400918 811 ntTSL 234.7■■■■□ 3.151e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-209ENST00000428120 2313 ntTSL 1 (best)34.37■■■■□ 3.091e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-205ENST00000401813 2543 ntTSL 1 (best)26.92■■□□□ 1.91e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-211ENST00000469733 2280 ntTSL 225.41■■□□□ 1.661e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-213ENST00000487186 3576 ntTSL 217.78■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 21
DROSHAQ9NRR4 CDH24-203ENST00000485922 2006 ntTSL 230.48■■■□□ 2.472e-11■■■■□ 20.9
DROSHAQ9NRR4 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 224.36■■□□□ 1.499e-7■■■■□ 20.9
DROSHAQ9NRR4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.593e-8■■■■□ 20.9
DROSHAQ9NRR4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.193e-8■■■■□ 20.9
DROSHAQ9NRR4 BMP4-208ENST00000559642 505 ntTSL 319.78■□□□□ 0.763e-8■■■■□ 20.9
DROSHAQ9NRR4 FAM160B2-203ENST00000450006 2846 ntTSL 1 (best)25.31■■□□□ 1.643e-6■■■■□ 20.9
DROSHAQ9NRR4 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 20.9
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-205ENST00000504092 920 ntTSL 529.64■■■□□ 2.336e-10■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-210ENST00000510739 774 ntTSL 324.7■■□□□ 1.556e-10■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-206ENST00000504784 418 ntTSL 321.77■■□□□ 1.086e-10■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.553e-11■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 ATXN2L-223ENST00000568266 1294 ntTSL 526.41■■□□□ 1.822e-10■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.44■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 521.88■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.228e-7■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.098e-7■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.28e-7■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.881e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-204ENST00000557961 591 ntTSL 236.47■■■■□ 3.431e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.141e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.321e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-220ENST00000559930 678 ntTSL 429.13■■■□□ 2.251e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.11e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-210ENST00000558893 1209 ntTSL 1 (best)19.74■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-209ENST00000558830 616 ntTSL 311.36□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-218ENST00000559697 551 ntTSL 59.74□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-214ENST00000559258 1047 ntTSL 28.56□□□□□ -1.041e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 27.63□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-206ENST00000558522 1074 ntTSL 27.63□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 MORF4L1-216ENST00000559619 448 ntTSL 26.96□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 SEC24C-206ENST00000634508 549 ntTSL 413.81□□□□□ -0.22e-8■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 SEC24C-207ENST00000635550 3424 ntTSL 210.6□□□□□ -0.712e-8■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 TROVE2-210ENST00000469214 592 ntTSL 324.38■■□□□ 1.494e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 TROVE2-207ENST00000415442 377 ntTSL 324.38■■□□□ 1.494e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 TROVE2-209ENST00000460715 1474 ntTSL 322.91■■□□□ 1.264e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.64e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 TROVE2-211ENST00000506303 613 ntTSL 317.09■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-6■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 215.57■□□□□ 0.083e-9■■■■□ 20.8
DROSHAQ9NRR4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 29.26□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP19-206ENST00000492211 5525 ntTSL 29.12□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 TLK1-204ENST00000413010 603 ntTSL 526.56■■□□□ 1.843e-7■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 TLK1-203ENST00000409443 2783 ntTSL 223.1■■□□□ 1.293e-7■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-7■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-7■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 514.1□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.273e-7■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 ITIH3-209ENST00000493136 2179 ntTSL 221.4■■□□□ 1.029e-18■■■■□ 20.7
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DROSHAQ9NRR4 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 20.7
DROSHAQ9NRR4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-9■■■■□ 20.6
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DROSHAQ9NRR4 ARL6IP1-206ENST00000566391 806 ntTSL 228.76■■■□□ 2.21e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 ARL6IP1-203ENST00000562234 391 ntTSL 526.62■■□□□ 1.851e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.291e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 ARL6IP1-208ENST00000569976 778 ntTSL 222.64■■□□□ 1.221e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 ARL6IP1-205ENST00000563861 948 ntTSL 1 (best)8.9□□□□□ -0.981e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 INTS1-202ENST00000468115 3051 ntTSL 218.72■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 FBRS-209ENST00000570170 1316 ntTSL 521.73■■□□□ 1.072e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 FBRS-206ENST00000494101 2782 ntTSL 221.14■□□□□ 0.972e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PSMG4-201ENST00000324987 778 ntTSL 341.65■■■■■ 4.265e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.265e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.095e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.595e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.545e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.475e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.155e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PSMG4-210ENST00000509933 2241 ntTSL 221.64■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PSMG4-208ENST00000454610 2323 ntTSL 221.28■■□□□ 15e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 226.09■■□□□ 1.778e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 324.16■■□□□ 1.468e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-204ENST00000503785 584 ntTSL 435.62■■■■□ 3.293e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.22e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.22e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 TFPT-204ENST00000420715 737 ntTSL 535.05■■■■□ 3.22e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-210ENST00000491139 582 ntTSL 333.37■■■□□ 2.932e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PPP1R37-204ENST00000540059 1719 ntTSL 232.89■■■□□ 2.862e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-208ENST00000481121 1543 ntTSL 231.9■■■□□ 2.72e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-208ENST00000510308 564 ntTSL 231.65■■■□□ 2.663e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.632e-7■■■■□ 20.6
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