Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DUOX2Q9NRD8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms