Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms