Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD163L1Q9NR16 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms