Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYLDQ9NQC7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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