Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP2Q9NPB3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP2Q9NPB3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms