Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTA1Q9NP79 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms