Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSU72Q9NP77 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSU72Q9NP77 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms