Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms