Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF408Q9H9D4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms