Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms