Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZYG11BQ9C0D3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZYG11BQ9C0D3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZYG11BQ9C0D3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZYG11BQ9C0D3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZYG11BQ9C0D3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms