Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZCCHC2Q9C0B9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZCCHC2Q9C0B9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms