Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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FOXQ1Q9C009 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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FOXQ1Q9C009 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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FOXQ1Q9C009 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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FOXQ1Q9C009 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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FOXQ1Q9C009 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FOXQ1Q9C009 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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