Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NLRP1Q9C000 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms