Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms