Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms