Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms